Et voksent menneske har 2 – 3 kg bakterier i tarmsystemet og langt størstedelen af alle menneskets bakterier lever i tarmsystemet. Vi har flere tarmbakterier (flere hundrede trillioner) end celler (ca. 75 trillioner) og der findes 500 – 1.000 bakteriearter i vores tarmsystem. Udover bakterier findes der også svampesporer og virus i tarmene.