Et voksent menneske har 2 - 3 kg bakterier i tarmsystemet og langt størstedelen af alle menneskets bakterier lever i tarmsystemet. Vi har flere tarmbakterier (flere hundrede billioner) end celler (ca. 75 billioner) og der findes 500 - 1.000 bakteriearter i vores tarmsystem. Udover bakterier findes der også svampesporer og virus i tarmene.